棕榈油厂生产过程中会产生很多废弃物质，废物处理是一个很大的挑战，如棕榈仁壳，空果串，污水等；  1. 棕榈油厂废弃物-棕榈仁壳(PKS)
  传统废弃物处理方法，棕榈厂压榨后的纤维和壳通常用作蒸汽锅炉的燃料。产生的蒸汽用于涡轮机发电。这两种固体燃料本身就能够产生足够的能量来实现棕榈油厂的消耗需求。
 2. 棕榈油厂废弃物-空果串（EFBs)
  与棕榈仁壳和纤维相比，空果串可以燃烧；也可以直接运回棕榈园做肥料用。
 3. 棕榈油厂废弃物-污水处理（POME）
   在传统棕榈油厂，加工一吨鲜果串，会产生600 - 700公斤废水。厌氧消化是业内广泛采用的污水处理方法。 棕榈油工厂产生的废水可厌氧转化为沼气，沼气反过来可通过燃气轮机和燃气发动机发电。
目前，壳和纤维用于工厂内部能源发电,但空果串用于肥料或扔掉。棕榈油行业有很大的潜力，可以生成大量的电力并输出至公共电网。